Kontrola podatkowa KAS — jak przebiega, jakie masz prawa i jak się przygotować?

List z urzędu skarbowego z zawiadomieniem o kontroli podatkowej — to chyba jedyna korespondencja, która potrafi zepsuć dzień każdemu przedsiębiorcy. Ale kontrola to nie wyrok. Jeśli wiesz, jak przebiega i jakie masz prawa, możesz przejść przez nią spokojnie.

Kto przeprowadza kontrole podatkowe?

Kontrola podatkowa KAS

Kontrole przeprowadzają dwa organy: naczelnik urzędu skarbowego (kontrola podatkowa na podstawie Ordynacji podatkowej) i naczelnik urzędu celno-skarbowego (kontrola celno-skarbowa na podstawie ustawy o KAS). Różnica? Kontrola celno-skarbowa jest „cięższa" — dotyczy poważniejszych spraw (podejrzenie oszustwa, wyłudzenie VAT, duże kwoty), ma szersze uprawnienia i może być przeprowadzona bez wcześniejszego zawiadomienia.

Standardowa kontrola podatkowa z US jest łagodniejsza — urząd musi Cię zawiadomić z 7-dniowym wyprzedzeniem i czas trwania jest ograniczony.

Zawiadomienie o kontroli — ile masz czasu?

Urząd skarbowy musi doręczyć zawiadomienie o zamiarze wszczęcia kontroli co najmniej 7 dni przed jej rozpoczęciem. Kontrola nie może się rozpocząć wcześniej niż 7. dnia i później niż 30. dnia od doręczenia zawiadomienia. Jeśli urząd nie rozpocznie kontroli w ciągu 30 dni — musi wysłać nowe zawiadomienie.

Wyjątki (kontrola bez zawiadomienia): podejrzenie popełnienia przestępstwa skarbowego, nieujawnione źródła przychodów, doręczenie zwrotów VAT, kontrola niezgłoszonej działalności, przeciwdziałanie praniu pieniędzy. Kontrola celno-skarbowa — zawsze bez zawiadomienia.

Jak przebiega kontrola?

Kontroler (upoważniony pracownik US) przyjeżdża do siedziby firmy lub miejsca prowadzenia działalności. Okazuje upoważnienie do kontroli i legitymację. Ma prawo: przeglądać księgi podatkowe, dokumenty, faktury, umowy, żądać wyjaśnień, przesłuchiwać pracowników, przeglądać systemy informatyczne (np. program księgowy).

Jako podatnik masz prawo: uczestniczyć w czynnościach kontrolnych, składać wyjaśnienia i zastrzeżenia, korzystać z pomocy doradcy podatkowego lub radcy prawnego, odmówić udostępnienia dokumentów niezwiązanych z przedmiotem kontroli.

Ile trwa kontrola?

Czas trwania kontroli podatkowej

Czas kontroli w jednym roku kalendarzowym jest ograniczony w zależności od wielkości firmy: mikroprzedsiębiorcy — max 12 dni roboczych, mali — max 18 dni, średni — max 24 dni, inni — max 48 dni. Przekroczenie limitu oznacza, że dowody zebrane po jego upływie nie mogą być wykorzystane.

Kontrola celno-skarbowa nie ma takich ograniczeń — może trwać znacznie dłużej.

Protokół kontroli — co dalej?

Po zakończeniu kontroli kontroler sporządza protokół z ustaleniami. Masz 14 dni na złożenie zastrzeżeń do protokołu. Kontroler musi się do nich ustosunkować. Jeśli kontrola wykaże nieprawidłowości — urząd może wszcząć postępowanie podatkowe i wydać decyzję z naliczonym podatkiem i odsetkami.

Lepsze rozwiązanie: korekta deklaracji. Jeśli po kontroli zgadzasz się z ustaleniami — złóż korektę zeznania i dopłać podatek z odsetkami. Odsetki przy dobrowolnej korekcie są niższe (50% stawki) niż przy decyzji wymiarowej.

Jak się przygotować do kontroli?

Profilaktyka jest najlepsza: prowadź rzetelną księgowość, przechowuj faktury i dokumenty minimum 5 lat, dbaj o spójność między JPK_VAT a ewidencją księgową, archiwizuj umowy z kontrahentami, dokumentuj transakcje z podmiotami powiązanymi (ceny transferowe).

Gdy dostaniesz zawiadomienie: skontaktuj się z biurem rachunkowym, przejrzyj dokumentację za kontrolowany okres, skonsultuj się z doradcą podatkowym (szczególnie jeśli wiesz o nieprawidłowościach), rozważ korektę deklaracji PRZED rozpoczęciem kontroli (możesz złożyć korektę do dnia wszczęcia kontroli — potem prawo to jest zawieszone).

Przeczytaj również

Często zadawane pytania

Ile wcześniej urząd musi zawiadomić o kontroli?
Minimum 7 dni przed planowaną kontrolą. Wyjątek: kontrola celno-skarbowa i kontrole bez zawiadomienia (podejrzenie przestępstwa, nieujawnione dochody).
Ile trwa kontrola podatkowa?
Zależy od wielkości firmy: 12 dni roboczych (mikro), 18 (małe), 24 (średnie) lub 48 (duże) w jednym roku kalendarzowym.
Czy mogę złożyć korektę w trakcie kontroli?
Nie — prawo do korekty jest zawieszone od dnia wszczęcia kontroli do jej zakończenia. Możesz złożyć korektę przed wszczęciem lub po otrzymaniu protokołu.
Czy muszę wpuścić kontrolera do firmy?
Tak, jeśli ma upoważnienie do kontroli i legitymację. Odmowa uniemożliwienia kontroli może skutkować karą porządkową do 3 700 PLN (kwota obowiązująca na lata 2025-2026 zgodnie z obwieszczeniem Ministra Finansów z 7 sierpnia 2024 r. na podstawie art. 262 §1 Ordynacji podatkowej).

Przydatne kalkulatory online